水利工程监理单位在质量监督过程中，常见问题主要包括以下几方面：
机构组建与人员配置问题：部分监理单位未按合同约定组建现场监理机构，或总监理工程师、主要监理人员驻现场时间不满足合同要求。同时，监理人员配备不满足工程建设需要，存在数量不足或专业不对口的情况，且部分监理人员未持证上岗，影响监理工作的专业性和权威性。
规划与细则编制问题：监理规划、实施细则编制、审批不规范，如监理规划未由总监理工程师主持编制，或监理实施细则未由专业监理工程师编制并经总监理工程师审批。此外，监理规划未明确监理实施细则编制计划，导致实施细则编制不完善，影响监理工作的系统性和针对性。
工作交底与制度执行问题：监理单位未进行监理工作交底，包括监理内部交底和向施工单位交底，导致监理团队成员和施工单位对监理程序、报验要求等不明确。同时，监理工作制度不健全，如未建立原材料、中间产品和工程设备报验制度、工程质量报验制度等，影响监理工作的规范性和有效性。
施工测量与工艺试验问题：监理单位在施工测量控制方面不到位，如未主持测量基准点、基准线和水准点的移交，或未审批承包人编制的施工控制网施测方案等。此外，对现场工艺试验方案审批不严，或未依据确认的现场工艺试验成果审查施工措施计划中的施工工艺，影响施工质量。